Το Π.Μ.Σ. υποβάλλει ετησίως την εσωτερική αξιολόγηση, που αποτελεί την τακτική παρακολούθηση, τον έλεγχο και τη διαδικασία αναθεώρησης του Π.Μ.Σ. και αποσκοπεί στη συνεχή βελτίωση του επιπέδου των εκπαιδευτικών παροχών και στη δημιουργία ενός υποστηρικτικού και αποτελεσματικού μαθησιακού περιβάλλοντος για τις/τους φοιτήτριες/ές. Η ΟΜΕΑ συνεργάζεται με τη ΜΟΔΙΠ ως μέρος της διαδικασίας της ετήσιας εσωτερικής αξιολόγησης του προγράμματος.

Το Π.Μ.Σ. έχει ξεκινήσει τη διαδικασία Εσωτερικής Αξιολόγησής του με τη συνεργασία της Συντονιστικής Επιτροπής, της ΟΜΕΑ του Τμήματος και της ΜΟΔΙΠ του Ιδρύματος. Ειδικότερα, έχουν δοθεί Οδηγίες από τη ΜΟΔΙΠ του Α.Π.Θ., σύμφωνα με τις απαιτήσεις του προτύπου Πιστοποίησης της ΕΘΑΑΕ. Το Π.Μ.Σ. παρακολουθεί και αξιολογεί τους δείκτες ποιότητας, όπως η ελκυστικότητα του Π.Μ.Σ., η αξιολόγηση των μαθημάτων και των μελών του διδακτικού προσωπικού από τις/τους φοιτήτριες/ές, η κινητικότητα, οι υπηρεσίες υποστήριξης των φοιτητριών/ών, τα έτη σπουδών τους, κ.λπ. Τέλος, παρακολουθείται ο βαθμός αλληλεπίδρασης του Π.Μ.Σ. με όλα τα ενδιαφερόμενα μέρη (φοιτήτριες/ές, απόφοιτες/ους και συνεργαζόμενους φορείς) και η ενημέρωσή τους. Το Π.Μ.Σ. οφείλει να υλοποεί τυχόν συστάσεις που πραγματοποιεί η ΜΟΔΙΠ στο πλαίσιο της εσωτερικής Αξιολόγησης.