Στο τέλος κάθε εξαμήνου γίνεται αξιολόγηση του Μ.Φ. με γραπτές ή/και προφορικές εξετάσεις σε όλα τα μαθήματα (θεωρητικά, κλινικά, εργαστηριακά, και άλλα).
Επιτυχής θεωρείται η παρακολούθηση και καταχωρείται ο αριθμός των Π.Μ. που αντιστοιχεί στο συγκεκριμένο μάθημα, αν ο εξεταζόμενος συγκεντρώσει βαθμολογία τουλάχιστον 6 σε κλίμακα 0-10 και συγχρόνως δεν έχει απουσιάσει άνω του 20% των διδακτικών ωρών του μαθήματος. Στις περιπτώσεις που δεν προσέλθει στις εξετάσεις ή βαθμολογηθεί με βαθμό 5 θα πρέπει να επαναξιολογηθεί, χωρίς να είναι υποχρεωμένος να επαναλάβει την παρακολούθηση του μαθήματος. Στις περιπτώσεις που ο φοιτητής βαθμολογηθεί με το βαθμό 0-4 είναι υποχρεωμένος να παρακολουθήσει και πάλι το μάθημα και στη συνέχεια να επαναξιολογηθεί. Και στις δύο προαναφερόμενες περιπτώσεις, δεύτερη αποτυχημένη εξέταση ή δεύτερη μη προσέλευση στις εξετάσεις, συνιστά αιτία διαγραφής του Μ.Φ. από το Π.Μ.Σ., η οποία θα πρέπει να γίνει με πρόταση της Σ.Ε. και απόφαση της Γ.Σ.
Ο τρόπος αξιολόγησης ορίζεται από τον διδάσκοντα του κάθε μαθήματος στην έναρξη του ακαδημαϊκού εξαμήνου. Το ποσοστό συμμετοχής σε άλλες εκπαιδευτικές δραστηριότητες (σε εργαστηριακές ασκήσεις, εργασιών και σεμιναρίων όπου προβλέπεται) καθορίζεται στον τελικό βαθμό του κάθε μαθήματος για κάθε μάθημα ξεχωριστά, έπειτα από εισήγηση του διδάσκοντα κάθε μαθήματος και εγκρίνεται από την Συντονιστική Επιτροπή του Π.Μ.Σ.
Η βαθμολογική κλίμακα για την αξιολόγηση της επίδοσης των μεταπτυχιακών φοιτητών ορίζεται από μηδέν (0) έως δέκα (10), ως εξής:
Ø Άριστα (8,5 έως 10)
Ø Λίαν Καλώς (6,5 έως 8,5 μη συμπεριλαμβανομένου)
Ø Καλώς (6 έως 6,5 μη συμπεριλαμβανομένου)
Προβιβάσιμος βαθμός είναι το έξι (6) και οι μεγαλύτεροί του